Análisis de re-arreglos genómicos en cáncer de próstata agresivo

Autores: Garza Guajardo Raquel, Cárdenas Cadena SA, Gómez Guerra LS, Garza Cortez R, Ortiz López Rocío, Grondin Y, Leach RJ, et al

Resumen

Los estadios iniciales del cáncer de próstata (CaP) representan un reto clínico, debido a la carencia de biomarcadores de evolución tumoral que definan si el mismo permanecerá localizado o cursará de manera agresiva y letal. En este trabajo se realizó un análisis sobre ganancias y pérdidas de regiones cromosómicas en dos grupos de muestras (CaP agresivo y no agresivo) con el objetivo de identificar loci asociados a una evo-lución agresiva o no agresiva del CaP. Métodos: Se realizaron microarreglos de hibridación genómica comparativa (aCGH) en muestras de ADN proveniente de tejido prostático (tumor primario) embebido en parafina de pacientes con diagnóstico de CaP agresivo (n = 15) y no agresivo (n = 8). Los datos proporcionados por el aCGH fueron analizados utilizando el agrupamiento no supervisado (centroides k-promedio) y supervisado (centroides reducidos) software R. Resultados: El agrupamiento no supervisado no generó correlación con la agresividad del CaP. El agrupamiento supervisado permitió obtener un perfil clasificador de aproximadamente 150 regiones cromosómicas, con un error de clasificación y falsos positivos de 30% y 20% respectivamente. Conclusiones: Se encontraron múltiples loci con y sin reportes previos de asociación a CaP agresivo. Debido al pequeño tamaño de la muestra se debe realizar un análisis más extenso para confirmar la asociación de dichas regiones encontradas con la agresividad del CaP.

Palabras clave: Cáncer de próstata agresivo microarreglos genómicos biomarcador México.

2011-09-05   |   1,089 visitas   |   Evalua este artículo 0 valoraciones

Vol. 71 Núm.3. Mayo-Junio 2011 Pags. 160-163 Rev Mex Urol 2011; 71(3)