Autores: Cifuentes Ricardo A., Barreto Emiliano
Selección supervisada de polimorfismos de nucleótido único en el sÃndrome de fatiga crónica Introducción: Las diferentes formas de seleccionar polimorfismos de nucleótido único se han relacionado con conclusiones paradójicas respecto a su utilidad para predecir el sÃndrome de fatiga crónica, incluso utilizando los mismos datos. Objetivo: Evaluar la eficacia para predecir este sÃndrome de los polimorfismos seleccionados mediante un enfoque supervisado, método que permite ayudar a identificar el perfil óptimo de los polimorfismos. Materiales y métodos: Se eliminaron los polimorfismos que no estaban en equilibrio de Hardy-Weinberg. Luego obtuvimos el perfil de polimorfismos mediante el enfoque supervisado y evaluamos tres aspectos: comparación de la exactitud de predicción con la del perfil obtenido mediante una selección basada en el desequilibrio de ligamiento, evaluación de la eficacia para determinar un estrato con mayor riesgo y estimación de la influencia del algoritmo de clasificación sobre la exactitud de predicción. Resultados: Se obtuvo un perfil válido (p < 0,01) con mayor exactitud que el basado en el desequilibrio de ligamiento, 72,8 Vs. 62,2% (p < 0,01), que incluyó el alelo mayor de NR3C1_11159943 y el menor de 5HTT_7911132, conocidos polimorfismos asociados a este sÃndrome. El dolor muscular o los sÃntomas de los senos paranasales en el estrato con el perfil, predijeron la presencia del sÃndrome con mayor exactitud que estos sÃntomas en toda la población, 87,1% Vs. 70,4% (p < 0,01) y 92,5% Vs. 71,8% (p < 0,01) respectivamente. El perfil llevó a una exactitud similar con diferentes algoritmos. Conclusiones: El enfoque supervisado permitió descubrir un perfil válido y confiable de polimorfismos asociado al sÃndrome de fatiga crónica. Se encontró la mayor exactitud reportada con estos datos que aumentó al combinarse con las variables clÃnicas.
Palabras clave: Polimorfismo genético sÃndrome de fatiga crónica biologÃa computacional inteligencia artificial biologÃa de sistemas desequilibrio de ligamiento.
2012-10-30 | 402 visitas | Evalua este artÃculo 0 valoraciones
Vol. 31 Núm.4. Octubre-Diciembre 2011 Pags. 613-621 Biomédica 2011; 31(4)